Konstruowa\u0142em cz\u0105steczki z wykorzystaniem fragmenr\u00f3w allenowych C=C=C. Intrygowa\u0142a mnie mo\u017cliwo\u015b\u0107 budowania cz\u0105steczek o kszta\u0142cie helikalnym. Wynika on z tego, \u017ce p\u0142aszczyzny podstawnik\u00f3w na obu skrzyd\u0142owych atomach uk\u0142adu allenowego s\u0105 prostopad\u0142e do siebie. Na poni\u017cszej r\u0119cznej animacji jest model, kt\u00f3ry skonstruowa\u0142em (ChemSketch\/ MM):<\/p>\n\n\n\n
Nazwa\u0142em go nieckenem od s\u0142owa niecka. Cz\u0105steczk\u0119 t\u0119 podda\u0142em optymalizacji> Na poziomie p\u00f3\u0142empirycznym zachowa\u0142 swoj\u0105 geometri\u0119 (MOPAC 22.1.1\/ PM7\/ bez cz\u0119sto\u015bci). T\u0119 struktur\u0119 podda\u0142em optymalizacji na poziomie DFT (Orca 5.0.4\/ revPBE\/ def2-TZVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n
Okaza\u0142o si\u0119, \u017ce wynik optymalizacji jest inny od oczekiwanego. Dwa pier\u015bcienie cyklooktatetraenowe przekszta\u0142ci\u0142y si\u0119 do uk\u0142ad\u00f3w pentalenowych. Nasun\u0119\u0142o mi to my\u015bl, \u017ce powinno by\u0107 mo\u017cliwe przekszta\u0142cenie jeszcze jednego cyklooktatetraenu do pentalenu. Dokona\u0142em r\u0119cznej modyfikacji i uzyskan\u0105 struktur\u0119 podda\u0142em oprymalizacji (warunki oblicze\u0144 jak wy\u017cej):<\/p>\n\n\n\n
Struktury te s\u0105 wi\u0119c izomeryczne. Co je r\u00f3\u017cni (opr\u00f3cz geometrii). Por\u00f3wna\u0142em obie energie swobodne Gibbsa. Wynosz\u0105 one -883.33850663 Eh oraz -883.26917632 Eh (z wynik\u00f3w oblicze\u0144 teromdynamicznych w plikach *.out programu Orca) odpowiednio dla cz\u0105steczki ostatniej i przedostatniej. Bez szczeg\u00f3\u0142owych oblicze\u0144 wida\u0107, \u017ce energia cz\u0105steczki pokazanej na ko\u0144cu jest ni\u017csza ni\u017c poprzedniej. Oznacza to, \u017ce gdyby za\u0142o\u017cy\u0107 istnienie r\u00f3wnowagi mi\u0119dzy nimi, to ta r\u00f3wnowaga by\u0142yby przesuni\u0119ta w kierunku cz\u0105steczki pokazanej na ko\u0144cu. Oznacza to, \u017ce uk\u0142ad skondensowanych pentalen\u00f3w jest faworyzowany ni\u017c uk\u0142ad skondensowanych cyklooktatetraen\u00f3w.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Konstruowa\u0142em cz\u0105steczki z wykorzystaniem fragmenr\u00f3w allenowych C=C=C. Intrygowa\u0142a mnie mo\u017cliwo\u015b\u0107 budowania cz\u0105steczek o kszta\u0142cie helikalnym. Wynika on z tego, \u017ce p\u0142aszczyzny podstawnik\u00f3w na obu skrzyd\u0142owych atomach uk\u0142adu allenowego s\u0105 prostopad\u0142e do siebie. Na poni\u017cszej r\u0119cznej animacji jest model, kt\u00f3ry skonstruowa\u0142em (ChemSketch\/ MM): Nazwa\u0142em go nieckenem od s\u0142owa niecka. Cz\u0105steczk\u0119 t\u0119 podda\u0142em optymalizacji> Na poziomie p\u00f3\u0142empirycznym […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[2],"tags":[],"class_list":["post-2837","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-chem"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2837","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2837"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2837\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3728,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2837\/revisions\/3728"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2837"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2837"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2837"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}