{"id":3115,"date":"2024-07-05T20:29:20","date_gmt":"2024-07-05T18:29:20","guid":{"rendered":"https:\/\/teneochem.pl\/?page_id=3115"},"modified":"2025-01-30T15:18:48","modified_gmt":"2025-01-30T15:18:48","slug":"srubeny","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/srubeny\/","title":{"rendered":"Srubeny"},"content":{"rendered":"\n

Nazwa pochodzi od \u015bruby. Nale\u017cy jednak powiedzie\u0107, \u017ce nie wszystkie poni\u017cej pokazane struktury maj\u0105 charakter helikalny. Niech tak ju\u017c zostanie. Struktury podobne pojawi\u0142y si\u0119 ju\u017c poprzednio<\/a>. Tutaj wzi\u0105\u0142em je na tapet. Upro\u015bci\u0142em zagadnienie a\u017c do cyklookta-1,2,5,6-tetraenu tu w konfiguracji (1P<\/em>,5P<\/em>). Cz\u0105steczk\u0119 zoptymalizowa\u0142em na poziomie DFT (Orca 4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Ciekawi\u0142o mnie, na ile mog\u0119 wyd\u0142u\u017ca\u0107 nienasycone mostki. Wys\u0142u\u017cy\u0142em \u0142a\u0144cuchy nienasycone do pi\u0119ciu atom\u00f3w w\u0119gla, co da\u0142o cz\u0105steczk\u0119 pokazan\u0105 poni\u017cej (Orca 5.0.4\/ revPBE\/ def2-TZVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Moleku\u0142a jest r\u00f3wnie\u017c chiralna i wykazuje konfiguracj\u0119 P<\/em>. Rozumowa\u0142em, \u017ce parzysta liczba atom\u00f3w w\u0119gla w mostkach powinna da\u0107 cz\u0105steczk\u0119 achiraln\u0105. Rozbudowa\u0142em wi\u0119c mostki do sze\u015bciu atom\u00f3w w\u0119gla (parametry oblicze\u0144 jak wy\u017cej):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Obliczenia pokaza\u0142y, \u017ce rzeczywi\u015bcie brak jest skr\u0119cenia mog\u0105cego generowa\u0107 chiralno\u015b\u0107. Podobnie sytuacja ma si\u0119 dla cz\u0105steczki z mostkami o\u015bmiow\u0119glowymi (parametry oblicze\u0144 jak wy\u017cej):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Rozbudowa\u0142em cz\u0105steczk\u0119 jeszcze bardziej. Umie\u015bci\u0142em w mostkach po trzyna\u015bcie atom\u00f3w w\u0119gla, co sugerowa\u0142o, \u017ce b\u0119dzie skr\u0119cona (Orca 4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Pokazana powy\u017cej cz\u0105steczka ma konfiguracj\u0119 P<\/em>. <\/p>\n\n\n\n

Obliczenia chcia\u0142em zako\u0144czy\u0107 na cz\u0105steczce z mostkami dziesi\u0119ciow\u0119glowymi. S\u0105dzi\u0142em, \u017ce b\u0119dzie po prostu p\u0142aska i niechiralna. Myli\u0142em si\u0119. Cz\u0105steczka z tak d\u0142ugim mostkiem nienasyconym wykazuje dziwne w\u0142a\u015bciwo\u015bci (Orca 5.0.4\/ revPBE\/ def2-TZVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Ustawi\u0142em tak cz\u0105steczk\u0119, aby o\u015b \u0142\u0105cz\u0105ca tetraedryczne atomy w\u0119gla by\u0142a prostopad\u0142a do oka parz\u0105cego (nieanimowany rysunek poni\u017cej):<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/figure>\n\n\n\n

Wida\u0107, \u017ce jedno rami\u0119 jest skr\u0119cone w kierunku P<\/em> (+117.7\u00b0) a drugie jest niemal p\u0142askie. Tutaj k\u0105t torsyjny wynosi +5\u00b0. Spodziewa\u0142em si\u0119 zupe\u0142nie p\u0142askiej cz\u0105steczki. To znaczy, \u017ce oba wymienione tu k\u0105ty torsyjne powinny by\u0107 bliskie 0\u00b0. Usi\u0142owa\u0142em „wyp\u0142aszczy\u0107” cz\u0105steczk\u0119 r\u0119cznie. Uda\u0142o mi si\u0119 uzyska\u0107 p\u0142asko\u015b\u0107 nienasyconych mostk\u00f3w. Zaskoczeniem jest jednak to, \u017ce mostki metylenowe „wyskakuj\u0105” z tej p\u0142aszczyzny (parametry oblicze\u0144 jak wy\u017cej):<\/p>\n\n\n\n

<\/div>\n\n\n\n

Mo\u017cna zatem powiedzie\u0107, \u017ce cz\u0105steczka przyjmuje konformacj\u0119 \u0142\u00f3dkow\u0105. Zastosowa\u0142em w u\u017cytym nazewnictwie podobie\u0144stwo do nomenklatury konformer\u00f3w cykloheksanu. Nie optymalizowa\u0142em konformacji omawianej moleku\u0142y krzes\u0142owej (lipiec 2024). Na tym etapie nie mam wyja\u015bnienia, dlaczego ta cz\u0105steczka nie jest p\u0142aska.<\/p>\n\n\n\n

Jeszcze jeden \u015bruben<\/a> (15 lipca 2024)<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Nazwa pochodzi od \u015bruby. Nale\u017cy jednak powiedzie\u0107, \u017ce nie wszystkie poni\u017cej pokazane struktury maj\u0105 charakter helikalny. Niech tak ju\u017c zostanie. Struktury podobne pojawi\u0142y si\u0119 ju\u017c poprzednio. Tutaj wzi\u0105\u0142em je na tapet. Upro\u015bci\u0142em zagadnienie a\u017c do cyklookta-1,2,5,6-tetraenu tu w konfiguracji (1P,5P). Cz\u0105steczk\u0119 zoptymalizowa\u0142em na poziomie DFT (Orca 4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus): Ciekawi\u0142o mnie, na ile mog\u0119 […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-3115","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3115","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=3115"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3115\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3519,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3115\/revisions\/3519"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=3115"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}