Nasza jest zbitkiem greckiego liczebnika i spolszczonego pocz\u0105tku nazwiska Schlegel. Nazwisko wzi\u0119\u0142o si\u0119 st\u0105d, \u017ce przy projektowaniu tych drobin korzysta\u0142em z diagramu Schlegela. U\u0142atwia\u0142 mi on zrozumienie sposobu \u0142\u0105czenia atom\u00f3w w\u0119gla. Struktura cz\u0105steczki, kt\u00f3r\u0105 skonstruowa\u0142em i podda\u0142em optymalizacji za pomoc\u0105 mechaniki molekularnej pokazana jest poni\u017cej (ChemSketch 2015\/ MM):<\/p>\n\n\n\n
Przekr\u00f3j cz\u0105steczki sk\u0142ada si\u0119 z siedmiu atom\u00f3w w\u0119gla, st\u0105d nazwa. Cz\u0105steczk\u0119 t\u0119 podda\u0142em optymalizacji na poziomie DFT (Orca 4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n
Okaza\u0142o si\u0119, \u017ce zasz\u0142y daleko id\u0105ce zmiany w strukturze. Pojawi\u0142y si\u0119 pier\u015bcienie, tr\u00f3j- cztero- i pi\u0119ciocz\u0142onowe. Nie by\u0142o ich w drobinie wyj\u015bciowej. Raczej zdziwiony tym wynikiem „uwodorni\u0142em” jedno wi\u0105zanie podw\u00f3jne tworz\u0105c z cz\u0105steczki o wzorze C35<\/sub>H16<\/sub> now\u0105 o wzorze C35<\/sub>H18<\/sub>. T\u0119 struktur\u0119 zoptymalizowa\u0142em na poziomie p\u00f3\u0142empirycznym (Orca 4.2.1\/ PM3\/ hess-plus). Da\u0142a si\u0119 r\u00f3wnie\u017c zrelaksowa\u0107 (wszystkie warto\u015bci hessianu s\u0105 dodatnie – nast\u0105pi\u0142a relaksacja):<\/p>\n\n\n\n Zauwa\u017cy\u0142em, \u017ce powsta\u0142a nanorurka nie jest prosta. Przy odpowiednim ustawieniu cz\u0105steczki wida\u0107 zgi\u0119cie. Nie by\u0142em pewny, czy jest to wynik obecno\u015bci wi\u0105za\u0144 podw\u00f3jnych w specyficznym miejscach, czy inna przyczyna (mo\u017ce niedok\u0142adno\u015b\u0107 obliczeniowa). W celu sprawdzenia geometrii skonstruowa\u0142em cz\u0105steczk\u0119 ca\u0142kowicie uwodornion\u0105 C35H46. Po wykonaniu optymalizacji (Orca 5.0.4\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-minus) okaza\u0142o si\u0119, \u017ce i taka nanorurka jest nieco zgi\u0119ta:<\/p>\n\n\n\n Okaza\u0142o si\u0119 jednak, \u017ce struktura nie jest zrelaksowana i posiada jedn\u0105 cz\u0119sto\u015b\u0107 ujemn\u0105 o warto\u015bci mniejszej ni\u017c -100 cm-1<\/sup>. Zachowanie si\u0119 tego „drgania” nie wskaza\u0142o mi jego usuni\u0119cia przez dokonanie jakich\u015b zmian strukturalnych. Powr\u00f3ci\u0142em wi\u0119c do struktury nienasyconej. Widz\u0105c, \u017ce jest zgi\u0119cie, skonstruowa\u0142em uk\u0142ad makrocykliczny o wzorze C310<\/sub>H86<\/sub>. Taka du\u017ca cz\u0105steczka sprawi\u0142a mi jednak k\u0142opot (Orca 4.2.1\/ PM3\/ hess-minus):<\/p>\n\n\n\n R\u00f3wnie\u017c ta struktura nie jest zrelaksowana (jedna ujemna warto\u015b\u0107 w\u0142asna w hessianie). Wydaje mi si\u0119, \u017ce jest to wynik niezachowania przeze mnie porz\u0105dku przy tak du\u017cej rozbudowie konstrukcji. Nie potrafi\u0142em jednak przy dost\u0119pnych mi narz\u0119dziach i moim poziomie umiej\u0119tno\u015bci zbudowa\u0107 cz\u0105steczki o wi\u0119kszym uporz\u0105dkowaniu. Mo\u017ce do si\u0119 uda w przysz\u0142o\u015bci, na co mam nadziej\u0119.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Nasza jest zbitkiem greckiego liczebnika i spolszczonego pocz\u0105tku nazwiska Schlegel. Nazwisko wzi\u0119\u0142o si\u0119 st\u0105d, \u017ce przy projektowaniu tych drobin korzysta\u0142em z diagramu Schlegela. U\u0142atwia\u0142 mi on zrozumienie sposobu \u0142\u0105czenia atom\u00f3w w\u0119gla. Struktura cz\u0105steczki, kt\u00f3r\u0105 skonstruowa\u0142em i podda\u0142em optymalizacji za pomoc\u0105 mechaniki molekularnej pokazana jest poni\u017cej (ChemSketch 2015\/ MM): Przekr\u00f3j cz\u0105steczki sk\u0142ada si\u0119 z siedmiu atom\u00f3w […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-3094","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3094","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=3094"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3094\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3657,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/3094\/revisions\/3657"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=3094"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}