{"id":2094,"date":"2024-03-18T21:54:27","date_gmt":"2024-03-18T20:54:27","guid":{"rendered":"https:\/\/teneochem.pl\/?page_id=2094"},"modified":"2025-01-30T14:42:18","modified_gmt":"2025-01-30T14:42:18","slug":"spiroalleny2","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/spiroalleny2\/","title":{"rendered":"Spiroalleny2"},"content":{"rendered":"\n<p>Chcia\u0142bym wr\u00f3ci\u0107 do modelu z rysunku nr 4 na poprzedniej stronie. Dogodne u\u0142o\u017cenie atom\u00f3w wodoru grup CH s\u0105siednich pier\u015bcieni zasugerowa\u0142o mi mo\u017cliwo\u015b\u0107 ich zst\u0105pienia i&nbsp;po\u0142\u0105czenia &#8222;uwolnionych&#8221; warto\u015bciowo\u015bci atom\u00f3w w\u0119gla fragmentami butatrienowymi  o&nbsp;postaci -CH=C=C=CH- (Orca4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/nowe\/spiroalleny\/ciekawy-ale-ov.sdf' data-backgroundcolor='#FF9933' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4' data-spin='axis:x;speed:1'><\/div>\n\n\n\n<p>Jest to dla mnie niezwykle intryguj\u0105ca cz\u0105steczka. Fragmenty butatrienowe do\u015b\u0107 naturalnie uk\u0142adaj\u0105 si\u0119 naprzemiennie jeden obok drugiego. Co ciekawe, drobin\u0119 t\u0119 mo\u017cna nie tylko rozbudowywa\u0107 wzd\u0142u\u017c, ale r\u00f3wnie\u017c niejako w poprzek zast\u0119puj\u0105c odpowiednie pary atom\u00f3w wodoru kolejnymi fragmentami butatrienowymi (parametry oblicze\u0144 jak wy\u017cej &#8211; 3Dmol niekt\u00f3re wi\u0105zania podw\u00f3jne pomija i traktuje je jak wi\u0105zania pojedyncze &#8211; mo\u017cna ten stan zmieni\u0107 r\u0119cznie w pliku sdf, albo mol, ale pozostawi\u0142em krotno\u015b\u0107 wi\u0105za\u0144 bez modyfikacji):<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/nowe\/spiroalleny\/ciekawy-ale1-ov1.sdf' data-backgroundcolor='#FF9933' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4' data-select='atom:C,H,N'><\/div>\n\n\n\n<p>Kontynuowa\u0142em rozbudow\u0119 cz\u0105steczki przez dodawanie kolejnych fragment\u00f3w butatrienowych (C<sub>47<\/sub>H<sub>12<\/sub> &#8211; parametry optymalizacji jak wy\u017cej):<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/nowe\/spiroalleny\/ciekawy-ale2-onv-C47H12.sdf' data-backgroundcolor='#FF9933' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4'><\/div>\n\n\n\n<p>I kolejnych do cz\u0105steczki zawieraj\u0105cej 59 atom\u00f3w w\u0119gla &#8211; C<sub>59<\/sub>H<sub>12<\/sub> (Orca4.2.1\/ PM3\/ hess-plus, Mopac22\/ PM7\/ hess-plus)<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/nowe\/spiroalleny\/ciekawy-ale3-pm3-onv-C59H12.sdf' data-backgroundcolor='#FF9933' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4'><\/div>\n\n\n\n<p>Okaza\u0142o si\u0119, \u017ce atomy wodoru s\u0105 tak usytu\u0142owane, \u017ce pozwala\u0142y si\u0119 zast\u0105pi\u0107 nast\u0119pnymi ugrupowaniami butatrienowymi i osi\u0105gn\u0105\u0107 liczb\u0119 107 atom\u00f3w w\u0119gla w cz\u0105steczce bez zmiany liczby 12 atom\u00f3w wodoru  &#8211; C<sub>107<\/sub>H<sub>12<\/sub> (MOPAC22\/ PM7\/ hess-plus, Orca4.2.1\/ PM3\/ Hess-plus):<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/nowe\/spiroalleny\/ciekawy-ale5-po-roku.sdf' data-backgroundcolor='#FF9933' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4'><\/div>\n\n\n\n<p>Ostatni\u0105 cz\u0105steczk\u0105 w tym etapie prac nad spiroallenami by\u0142a moleku\u0142a powsta\u0142a przez insercj\u0119 atomu w\u0119gla =C= do fragment\u00f3w allenowych pierwszej cz\u0105steczki pokazanej w cz\u0119\u015bci pierwszej tego wpisu. Oznacza to, \u017ce ka\u017cdy \u0142a\u0144cuch nienasycony jest uk\u0142adem butatrienowym (\u015bci\u015blej m\u00f3wi\u0105c powsta\u0142y uk\u0142ad nie ma charakteru allenowego, ale zostawiam go tutaj ze wzgl\u0119du na spos\u00f3b jego wygenerowania). Cz\u0105steczka o wzorze C<sub>31<\/sub>H<sub>12<\/sub> zosta\u0142a zoptymalizowana na poziomie DFT (Orca4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus):<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/nowe\/spiroalleny\/ciekawy-nowy-onv-C31H16.sdf' data-backgroundcolor='#FF9933' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4'><\/div>\n\n\n\n<p>Mo\u017cna zauwa\u017cy\u0107, \u017ce w cz\u0105steczce tej znajduj\u0105 si\u0119 skrzyd\u0142owe grupy metylenowe. Pozwalaj\u0105 one na powielenie cz\u0105steczki wyj\u015bciowej i utworzenie jej spiranowej wielokrotno\u015bci. Tego zagadnienia jednak nie bada\u0142em (marzec 2024).<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Chcia\u0142bym wr\u00f3ci\u0107 do modelu z rysunku nr 4 na poprzedniej stronie. Dogodne u\u0142o\u017cenie atom\u00f3w wodoru grup CH s\u0105siednich pier\u015bcieni zasugerowa\u0142o mi mo\u017cliwo\u015b\u0107 ich zst\u0105pienia i&nbsp;po\u0142\u0105czenia &#8222;uwolnionych&#8221; warto\u015bciowo\u015bci atom\u00f3w w\u0119gla fragmentami butatrienowymi o&nbsp;postaci -CH=C=C=CH- (Orca4.2.1\/ B3LYP\/ def2-SVP\/ hess-plus): Jest to dla mnie niezwykle intryguj\u0105ca cz\u0105steczka. Fragmenty butatrienowe do\u015b\u0107 naturalnie uk\u0142adaj\u0105 si\u0119 naprzemiennie jeden obok drugiego. Co [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-2094","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2094","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2094"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2094\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3600,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/2094\/revisions\/3600"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2094"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}