Swego rodzaju niespodziank\u0105 jest zachowanie si\u0119 jednego z „ramion” powy\u017cej przedstawionego zwi\u0105zku. Zar\u00f3wno jeden pier\u015bcie\u0144 skrzyd\u0142owy jak i pier\u015bcie\u0144 wewn\u0119trzny (po prawej stronie) przekszta\u0142ci\u0142y si\u0119 w uk\u0142ady formalnie bicykliczne. Ilustruje to rysunek poni\u017cej (pier\u015bcienie po lewej stronie zachowa\u0142y cykliczny charakter sze\u015bciocz\u0142onowy):<\/p>\n\n\n\n To zjawisko spowodowa\u0142o zmian\u0119 charakteru wi\u0105za\u0144 w dw\u00f3ch \u0142a\u0144cuchach z oligoenowego na trietynowy (dok\u0142adniej z oktaheptaenowego na oktatriynowy). <\/p>\n\n\n\n Jeszcze wi\u0119cej k\u0142opot\u00f3w interpretacyjnych sprawi\u0142a cz\u0105steczka, w kt\u00f3rej jedno potr\u00f3jne rami\u0119 enowe zosta\u0142o skr\u00f3cone o jeden atom w\u0119gla w ka\u017cdym \u0142a\u0144cuchu tego ramienia (Orca4.2.1\/B3LYP\/def2-SVP\/hess-plus):<\/p>\n\n\n\n Widoczne jest skr\u0119cenie cz\u0105steczki na ramieniu nieparzystym (z nieparzyst\u0105 liczb\u0105 atom\u00f3w w\u0119gla w \u0142a\u0144cuchach) powoduj\u0105ce, \u017ce jest ona enancjomerem M. Na powy\u017cszej animacji widoczne s\u0105 r\u00f3wnie\u017c k\u0142opoty z przyporz\u0105dkowaniem krotno\u015bci wi\u0105za\u0144 przez algorytm programu 3DMol. Powsta\u0142y one prawdopodobnie w wyniku tego, \u017ce pier\u015bcie\u0144 skrzyd\u0142owy w ramieniu z parzyst\u0105 liczb\u0105 atom\u00f3w w \u0142a\u0144cuchach przyj\u0105\u0142 charakter uk\u0142adu bicyklicznego. Nie jestem tego w stanie oceni\u0107 w tym momencie (luty 2024).<\/p>\n\n\n\n Chcia\u0142bym przedstawi\u0107 jeszcze dwie cz\u0105steczki, kt\u00f3re powsta\u0142y w wyniku nieuwa\u017cnych prac konstrukcyjnych. Pierwsza z nich wpowsta\u0142a przypadkiem w wyniku po\u0142\u0105czenia ko\u0144c\u00f3w jednego z \u0142a\u0144cuch\u00f3w z atomami w\u0119gla znajduj\u0105cymi si\u0119 po przeziwnych stronach pier\u015bcieni skrzyd\u0142owych:<\/p>\n\n\n\n Niestety okaza\u0142o si\u0119, \u017ce cz\u0105steczka zoptymalizowana na poziomie DFT (Orca4.2.1\/B3LYP\/def2-SVP) nie jest zrelaksowana i wykazuje jedn\u0105 cz\u0119sto\u015b\u0107 ujemn\u0105. Nie jest jasne, czy istnieje mo\u017cliwo\u015b\u0107 jej zrelaksowania be\u017c istotnej modyfikacji struktury. W przeciwie\u0144stwie do tego druga struktura jest zrelaksowana (Orca4.2.1\/B3LYP\/def2-SVP\/hess-plus) lecz nie ma cech estetyki pierwszej z nich:<\/p>\n\n\n\n Na koniec przygody z rybenami chc\u0119 pokaza\u0107 struktur\u0119, kt\u00f3ra powsta\u0142a w wyniku zamkni\u0119cia w uk\u0142ad makrocykliczny o\u015bmiu ryben\u00f3w sk\u0142adaj\u0105cych si\u0119 z dw\u00f3ch \u0142a\u0144cuch\u00f3w sze\u015bciow\u0119glowych i jednego czterow\u0119glowego. Wynikiem strukturalnym tak pomy\u015blanej konstrukcji jest cz\u0105steczka alotropu w\u0119gla C120<\/sub> (Orca4.2.1\/HF\/6-31G(d)\/hess-plus):<\/p>\n\n\n\n Pi\u0119kno tej struktury jest nieco popsute przez do\u015b\u0107 dowolne traktowanie przez program graficzny krotno\u015bci wi\u0105za\u0144. Niestety niekt\u00f3re atomy w\u0119gla na animacji powy\u017cej s\u0105 pi\u0119ciowi\u0105zalne. Wprawdzie da\u0142oby si\u0119 ten b\u0142\u0105d poprawi\u0107 r\u0119cznie, ale pozostawi\u0142em rysunek w tej surowej, ale urzekaj\u0105cej przecie\u017c swoim pi\u0119knem formie.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Kolejny krok analizy struktur ryben\u00f3w polega\u0142 na po\u0142\u0105czeniu dw\u00f3ch cz\u0105steczek tych zwi\u0105zk\u00f3w ze sob\u0105 za pomoc\u0105 trzech mostk\u00f3w etenowych w celu stworzenia struktur bardziej wyd\u0142u\u017conych. Na modelu poni\u017cej widoczny jest rezultat takiego po\u0142\u0105czenia (Orca4.2.1\/HF\/6-31G(d)\/hess-plus): Swego rodzaju niespodziank\u0105 jest zachowanie si\u0119 jednego z „ramion” powy\u017cej przedstawionego zwi\u0105zku. Zar\u00f3wno jeden pier\u015bcie\u0144 skrzyd\u0142owy jak i pier\u015bcie\u0144 wewn\u0119trzny (po […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1773","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1773","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1773"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1773\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3576,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1773\/revisions\/3576"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1773"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}![\"\"](\"http:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/02\/di-ryben-888-HFd-C60H12.png\")