{"id":1618,"date":"2024-01-25T19:45:37","date_gmt":"2024-01-25T18:45:37","guid":{"rendered":"https:\/\/teneochem.pl\/?page_id=1618"},"modified":"2025-01-29T21:28:47","modified_gmt":"2025-01-29T21:28:47","slug":"zagrodeny-cd","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/zagrodeny-cd\/","title":{"rendered":"Zagrodeny-cd"},"content":{"rendered":"\n<p>Struktury zagroden\u00f3w oferuj\u0105 inne ciekawe mo\u017cliwo\u015bci do zbadania. Przede wszystkim zale\u017ca\u0142o mi, \u017ceby si\u0119 dowiedzie\u0107, czy modele poszerzone o jedn\u0105 warstw\u0119 daj\u0105 stabilne geometrie. W tym celu skonstruowa\u0142em uk\u0142ady geometryczne zawieraj\u0105ce 3, 4, 5, 6 oraz 9 \u0142a\u0144cuch\u00f3w homoallenowych w ka\u017cdej warstwie (czyli w dwu warstwach og\u00f3\u0142em). Podobnie jak poprzednio przyj\u0105\u0142em, \u017ce modele te b\u0119d\u0105 mia\u0142y oznaczenia zagroden<strong>x<\/strong>-3, gdzie <strong>x<\/strong> jest liczb\u0105 \u0142a\u0144cuch\u00f3w homoallenowych w warstwie, natomiast 3 oznacza liczb\u0119 dw\u00f3ch skrzyd\u0142owych pier\u015bcieni po\u0142\u0105czonych grupami metylenowymi plus jeden pier\u015bcie\u0144 \u015brodkowy.  <\/p>\n\n\n\n<p>Analiz\u0119 struktur rozpocz\u0105\u0142em od zagrodenu3-3. Optymalizacj\u0119 wykona\u0142em na poziomie HF\/6-31G(d)\/hess-plus (a tak\u017ce na poziomie DFt &#8211; B3LYP\/def2-SVP\/hess-plus). Poni\u017cej zamieszczony jest aktywny model 3D zagrodenu3-3:<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/zagrodeny\/zagroden3-3-HFd-ov-ok.mol' data-backgroundcolor='yellow' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4'><\/div>\n\n\n\n<p>Ma\u0142a \u015brednica w tej strukturze wywo\u0142uje napr\u0119\u017cenie objawiaj\u0105ce si\u0119 zagi\u0119ciem uk\u0142adu homoallenowego. To napr\u0119\u017cenie jest mniejsze w nast\u0119pnym modelu zagrodenu4-3 [HF\/6-31G(d)\/hess-plus] ale tak\u017ce na poziomie DFT (Orca.4.2.1\/B3LYP\/def2-SVP\/hess-plus):<\/p>\n\n\n\n<div style=\"height: 300px; width: 300px; position: relative;\" class='viewer_3Dmoljs' data-href='https:\/\/teneochem.pl\/struct\/zagrodeny\/zagroden4-3-HFd-ov.mol' data-backgroundcolor='yellow' data-style='stick:radius~0.2;sphere:radius~0.4'><\/div>\n\n\n\n<p>Mo\u017cna tu wyr\u00f3\u017cni\u0107 dwa k\u0105ty walencyjnie w \u0142a\u0144cuchu homoallenowym wynosz\u0105ce 157.4\u00b0 oraz 160.9\u00b0 s\u0105 to k\u0105ty odpowiednio dla trzech wewn\u0119trznych i trzech zewn\u0119trznych atom\u00f3w w\u0119gla \u0142a\u0144cuch\u00f3w homoallenowych.<\/p>\n\n\n\n<p>Poni\u017cej znajduj\u0105 si\u0119 obrazy zagrodenu5-3 oraz 6-3 (obrazy wygenerowane przez Avogadro 1.98.1):<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"1280\" height=\"720\" src=\"http:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/01\/zagrodeny-5-6-3.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-1627\" srcset=\"https:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/01\/zagrodeny-5-6-3.jpg 1280w, https:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/01\/zagrodeny-5-6-3-300x169.jpg 300w, https:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/01\/zagrodeny-5-6-3-1024x576.jpg 1024w, https:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/01\/zagrodeny-5-6-3-768x432.jpg 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 1280px) 100vw, 1280px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p>Obliczenia dla powy\u017cszych struktur zosta\u0142y wykonane na poziomie HF\/6-31G(d)\/hess-plus. Nie bada\u0142em struktur zagroden\u00f3w7-3 oraz 8-3. Natomiast przedmiotem bada\u0144 by\u0142 zagroden9-3. Obliczenia za pomoc\u0105 programu Orca4.2.1 na poziomie HF\/6-31G(d) wykaza\u0142y obecno\u015b\u0107 czterech ujemnych cz\u0119sto\u015bci (film &#8211; program Avogadro 1.98.1 jest poni\u017cej):<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-video\"><video height=\"1080\" style=\"aspect-ratio: 1920 \/ 1080;\" width=\"1920\" controls src=\"http:\/\/teneochem.pl\/wp-content\/uploads\/2024\/01\/zagroden9-3-drgania.mp4\"><\/video><\/figure>\n\n\n\n<p> Zachowanie si\u0119 drga\u0144 ujemnych sugeruje, \u017ce droga do ich likwidacji powinna polega\u0107, jak s\u0105dz\u0119, na przegi\u0119ciu niekt\u00f3rych \u0142a\u0144cuch\u00f3w homoallenowych do wn\u0119trza cz\u0105steczki.  Zagadnienie to jest jednak w czasie publikacji tego wpisu (stycze\u0144 2024) nadal otwarte.<\/p>\n\n\n\n<p><a href=\"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/zagrodeny-cdcd\/\" data-type=\"link\" data-id=\"https:\/\/teneochem.pl\/zagrodeny-cdcd\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Cz\u0119\u015b\u0107 trzecia<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Struktury zagroden\u00f3w oferuj\u0105 inne ciekawe mo\u017cliwo\u015bci do zbadania. Przede wszystkim zale\u017ca\u0142o mi, \u017ceby si\u0119 dowiedzie\u0107, czy modele poszerzone o jedn\u0105 warstw\u0119 daj\u0105 stabilne geometrie. W tym celu skonstruowa\u0142em uk\u0142ady geometryczne zawieraj\u0105ce 3, 4, 5, 6 oraz 9 \u0142a\u0144cuch\u00f3w homoallenowych w ka\u017cdej warstwie (czyli w dwu warstwach og\u00f3\u0142em). Podobnie jak poprzednio przyj\u0105\u0142em, \u017ce modele te b\u0119d\u0105 [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-1618","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1618","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1618"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1618\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3461,"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1618\/revisions\/3461"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/teneochem.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1618"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}